Arm架构的macOS安装conda

在arm架构的macOS系统安装conda实际上并没有特别需要注意的地方，我们只需要在最初下载的时候，选择conda-forge提供的miniconda，即Miniforge

Miniforge是针对conda-forge优化的conda，做了如下的预设

• conda-forge作为默认channel
• PyPy的可选支持，替代标准Python(CPython)
• Mambda可选支持，替代conda
• 多种CPU架构支持(x86_64, ppc64le, aarch64(M1))

安装过程代码如下

# 下载
cd ~/Download
wget https://github.com/conda-forge/miniforge/releases/latest/download/Miniforge3-MacOSX-arm64.sh
# 安装
chmod +x ~/Downloads/Miniforge3-MacOSX-arm64.sh
sh ~/Downloads/Miniforge3-MacOSX-arm64.sh

运行时会有一些提示信息，输入yes或者回车就行，完成后会有如下信息

注意我在途中标识的部分，这里有两个信息我们需要指导

• 我们需要重启终端才能调用conda
• conda之后会默认启动base环节，除非你用 conda config --set auto_activate_base false 取消这个行为。

不过，遗憾的是许多生信软件还没有arm64版本，例如bwa, samtools 等，但是没有关系这些软件可以通过 homebrew 进行安装。