通常情况下,我们无法是直接在服务器上打开IGV,因为它既要求服务器上安装X服务,本地也要安装X服务,才能将服务器上的图形信息转发到本地。
事实上是要配置好X11转发,就可以在服务器上运行其他的图形界面程序。
第一步: 在服务器上配置Xserver(需要管理员权限)
1 | sudo yum install xorg-x11-server-Xorg xorg-x11-xauth xorg-x11-apps -y |
第二步: 在windows上配置X服务
我们从 https://sourceforge.net/projects/xming/ 下载Xming
安装完成后,右下角有Xming Server的地址信息,一般会是0.0或者1.0
第三步: 设置Xshell或Putty
第四步: 下载IGV并解压缩
1 | wget https://data.broadinstitute.org/igv/projects/downloads/2.8/IGV_Linux_2.8.13_WithJava.zip |
运行该目录下的 igv_hidpi.sh
或 igv.sh
即可