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从零开始学CIRCOS绘制圈图(五)

这一部分承接从零开始学CIRCOS绘制圈图(四),对之前的布局进行调整,使结构更加适合于发表。染色体的位置顺序默认情况下是会显示所有的染色体,而且会先从ath1到ath5,然后从aly1到aly8, 那么如何调整顺序呢?需要设置的参数是chromosomes_order, 按照自己的需求调整位置。

从零开始学CIRCOS绘制圈图(四)

通常circos的中间部分不是空白区域,会用一条条线进行连接,表示两个染色体部分区域有关系。数据格式对于link,circos要求输入数据至少有6列,分别是chr1 start1 end1 chr2 start2 end2 [options]举个例子chr110000002000000chr5300

从零开始学CIRCOS绘制圈图(三)

如何展示基因密度信息
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