Seurat的scATAC-seq分析流程

利用scRNA-seq的分析结果对scATAC-seq进行预测

使用TransDecoder寻找转录本中的编码区

TransDecoder能够从转录本序列中鉴定候选编码区。这些转录本序列可以来自于Trinity的从头组装,或者来自于Cufflinks或者StringTie的组装结果。

样本足够多时别用DESeq2,用非参数检验都行

在样本量比较小的时候,用复杂的模型是无奈之举,它有很多假设成分在,尤其是你还想从无重复的实验设计中算p值。当你样本量够多的时候,用最简单的模型其实就会有很好的结果。

3分的水稻转录组分析实战

转录组分析加上qRT-PCR实验验证,发个3分文章还是可以的
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