如何对基因组序列进行注释

如何注释你的基因组?

使用RepeatModeler和RepeatMasker注释基因组重复序列

利用从头注释构建的数据库比直接同源注释好一些

LTR_retriever: 一个更加准的LTR整合分析工具

LTR_retriever不是一个独立的工具,他的主要作用就是整合 LTRharvest, LTR_FINDER, MGEScan 3.0.0, LTR_STRUC, 和 LtrDetector的结果,过滤其中的假阳性LTR-RT,得到高质量的LTR-RT库。

「基因组注释」使用RepeatModeler从头注释基因组的重复序列

RepeatModeler可用来从头对基因组的重复序列家族进行建模注释,它的核心组件是RECON和RepatScout。
Your browser is out-of-date!

Update your browser to view this website correctly. Update my browser now

×