MAKER避免重复运算

如何避免不必要的运算

MAKER训练SNAP基因模型

SNAP模型的训练三要素,基因组,转录本和蛋白序列

MAKER配置文件详解

MAKER的配置文件介绍

MAKER的并行化初探

MAKER到底有没有在摸鱼

Apollo安装笔记

注释调整工具

如何对基因组序列进行注释

如何注释你的基因组?

使用BRAKER2进行基因组注释

基因组注释的一个流程化工具

使用Swiss-Prot根据同源基因进行注释

使用UniProt上的dat信息对基因进行功能注释

使用TransDecoder寻找转录本中的编码区

TransDecoder能够从转录本序列中鉴定候选编码区。这些转录本序列可以来自于Trinity的从头组装,或者来自于Cufflinks或者StringTie的组装结果。

DIAMOND: 超快的蛋白序列比对软件

没想到它的速度那么快,相见恨晚
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