我的2019年

当我开始写2019年总结的时候,我一时间不知道自己在这一年中做了些什么,总感觉自己忙忙碌碌,但是一无所获。

好在,我记录了,虽然不是以日记的形式,而是以一篇篇学习笔记的形式发布在网络上。当我将时间线拉回到2019年1月1日,然后慢慢向现在拉近时,我知道我这一年还是有一些进步的。

第一件值得开心的事,应该是我的个人博客xuzhougeng.top在7月25日的时候又上线了。这是我在2019年年初就想做的事情,我想要把自己简书上的内容完全由自己掌控,不再被无故404,目前已经有3万多人次访问。

其实搭建网站是我很小时候就想做的一件事情,那时候看到一篇文章写到用花生壳1元做自己的网站,就觉得这是一件很酷的事情。只不过无人指导,所以我一直在走弯路,但终于是把路走完了。

第二个事情,应该是我的编程水平的提高。我从年初就决定去学习数据结构和算法,只不过断断续续,最终也就是知道了大概,LeetCode上面的题目刷的还是不够。我尝试在R语言中使用Cpp提高代码运行速度,希望克服对C++的恐惧,从熟悉的语言切入慢慢掌握这门复杂的语言。我还挣扎在R语言绘图系统中,不断的看Y叔代码和ggplot2的源码,最终在翻译了ggproto相关内容后,对ggplot2和图形语法有所理解。

第三个应该是我的数据处理能力上的进步,因为踩了更多的坑,所以有了更多的项目经验

  • 学习使用Nanopore做基因组组装,把相关的工具都学了一遍,Canu/NECAT/NextDenovo/FLYE
  • 学习用HiC辅助基因组组装,相关工具为ALLHiC/3D-DNA/SALSA
  • 学习BioNano相关的知识点,发现了BioNano在处理杂合基因组上的不足,并且尝试去解决它。
  • 从年初开始的miRNA-seq项目,终于在年末和师兄的不断讨论中,理解了原理,并发现之前存在的问题。
  • 学了Shiny制作网页工具,用在了和师兄合作的单细胞文章数据展示上
  • 在简化基因组鉴定SNP和使用SNP进行下游分析上,我还在不断的思考
  • 学习了使用ANOVA进行QTL定位,当然还有质量性状的定位方法。也写了几篇BSA的教程。

除了学习上和技术外,我还坚持锻炼,去健身房撸铁。这需要感谢我的是一个师弟,在他的督促下,我保证了每周起码两次的撸铁,否则我更喜欢在电脑前发呆。目前肚子上还有一层肉,在新的一年里可能要多跑跑步,少喝奶茶才行了。

今年差不多就是这些,对于明年,我估计也会做上面这些事情,不断的学习,不断的写作。

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